Коронавирус / Coronavirus / COVID-19

Richman · 2011-08-10 14:48:18

Актуальные данные здесь.

AdSence · 2011-08-10 14:48:18

Richman · 2020-04-30 14:44:11

AdSence · 2020-04-30 14:44:11

Jassmine

Richman · 2020-04-30 15:01:21

SARS-CoV-2 может вызывать нарушения центральной нервной системы.
Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2) and the Central Nervous System

Richman · 2020-05-01 09:46:05

Швеция

Richman · 2020-05-02 04:17:57

Билл Гейтс и чипирование

Разоблачаем теорию заговоров

Пост Гейтса на Reddit:
[Ссылка]

Eventually we will have some digital certificates to show who has recovered or been tested recently or when we have a vaccine who has received it.

В итоге мы будем иметь цифровой сертификат, в котором имеются сведения об иммунитете на патогены, перенесённых заболеваниях, произведённых прививках.

(мой вольный перевод)

На следующий день скандальный сайт Biohackinfo.com сочинил статью Bill Gates will use microchip implants to fight coronavirus
[Ссылка]

Эту статью расшарили много тысяч раз, слепили видео
[Ссылка]

В статье приводится цитата Гейтса и декларируется:

The ‘digital certificates’ Gates was referring to are human-implantable ‘QUANTUM-DOT TATTOOS.'

Цифровые сертификаты Гейтса — это имплантируемые "КВАНТОВЫЕ ТАТУ"

Пытаюсь осмыслить, полная ахинея.
Это мешанина из двух невзаимосвязанных понятий.

Что можно понимать под цифровой сертификацией?

Во-первых, это зашифрованная информация, защищённая электронной подписью через интерент.
Открытый протокол Telecommunication Standardization Sector от 1988 года, скачать и сделать умный вид, что понимаете, можно здесь:
[Ссылка]

Когда Гейтс упоминул данную технологию, он имел в виду, что она будет использована для лаборатории самодиагностики на COVID-19 домашнего использования
[Ссылка]

Вот его высказывание:
[Ссылка]

The testing in the US is not organized yet. In the next few weeks I hope the Government fixes this by having a website you can go to to find out about home testing and kiosks… Whenever there is a positive test it should be seen to understand where the disease is and whether we need to strengthen the social distancing. South Korea did a great job on this including digital contact tracing.

В Соединёных Штатах до сих пор не организовано тестирование (на COVID-19).
Я надеюсь, что в течении нескольких недель появится сайт с информацией о том, где взять домашние тесты и найти киоски.
Если будут выявлены позитивные результаты тестов, это поможет нам понять, как распространяется эпидемия.
Южная Корея имеет огромные наработки в этой области.

Вот о системе тестирования в Южной Корее:
[Ссылка]

А вот корейский сайт с результатами тестов работающей системы:
[Ссылка]
Поскольку там имеется приватная информация, само собой, есть недовольства по поводу нарушения прав и свобод граждан.

И всё же, описанное очень далеко от "Имплантированных микрочипов".

Во-вторых, есть ещё одно, не связанное с текущей COVID-19 активностью, исследование, которое спонсирует Гейтс:
[Ссылка]
Проблема вакцинации в развивающихся странах — плохо организованная система учёта и сохранения информации о пациентах.
Разработчики предлагают сохранять результаты путём нанесения специального красителя на коже пациента.
Информацию можно будет прочесть и через 5 лет, используя специальную программу в смартфоне.

Kevin McHugh, профессор биоинженерии Rice University, сообщил, что

“These markings were developed to provide a vaccination record and there is no ability to track anyone’s movements, This technology is only able to provide very limited (e.g. non-personalized) data locally. These markings require direct line-of-sight imaging from a distance of less than 1 foot. Remote or continuous tracking is simply not possible for a variety of technical reasons.”

Информация ограниченная, содержит данные только о прививках и обезличенная. Её нельзя считать на расстоянии дальше чем 1 фут. Следовательно, нет никакой речи о её использовании для слежки за перемещениями человека.

Gates Foundation подтвердили, что данное исследование не имело отношения к COVID-19.

Pevochca

Richman · 2020-05-02 04:23:17

Билл Гейтс и ограничение рождаемости

Разоблачаем теорию заговоров

Читаем в оригинале:
[Ссылка]

There’s another benefit to the pattern Melinda describes—first more children survive, then families decide to have fewer children—which is that it can lead to a burst of economic growth that economists call “the demographic dividend.” Here’s how it works.
When more children live, you get one generation that’s relatively big. Then, when families decide to have fewer children, the next generation is much smaller. Eventually, a country ends up with relatively more people in the labor force producing economically—and relatively fewer dependents (very old or very young people). That’s a recipe for rapid economic development, especially if countries take advantage of it by investing in health and education.

Перевести можно примерно так:

Когда больше детей выживают после пяти лет, а матери могут решать, рожать ли им еще, численность населения не растет. Она снижается. Родители заводят меньше детей, когда они уверены, что их дети станут взрослыми.
Со временем в таком обществе меняется структура населения, в нем становится больше работников и меньше иждивенцев, а это способствует экономическому развитию.

Кто-то против того, чтобы развивающиеся страны плодили меньше детей за счёт меньшей детской смертности, хорошо их лечили, учили и получали в итоге общество с меньшей численностью, но лучшим качеством жизни?
Или пусть рожают десятками, живут в говне, болеют, голодают, умирают и плодят преступников. дикарей и беженцев?

Roza

Richman · 2020-05-02 10:33:17

Хорошие новости. Впервые вакцина защитила макак-резус от заражения вирусом MERS-CoV, который убивает > 1/3 зараженных. Платформа может быть использована для разработки вакцин против других новых коронавирусов, возможно, включая #SARSCoV2
Разработка вакцины для защиты от смертельных последствий многих штаммов коронавируса имеет решающее значение с учетом нынешней глобальной пандемии. Для коронавируса ближневосточного респираторного синдрома (MERS-CoV) мы показываем, что макаки-резус сероконвертировались быстро после однократной внутримышечной вакцинации ChAdOx1 MERS. Вакцина защищала от респираторных повреждений и пневмонии и снижала вирусную нагрузку в легочной ткани на несколько порядков. Репликация MERS-CoV в пневмоцитах типа I и II у вакцинированных ChERSOx1 животных MERS отсутствовала. Первичная бустерная схема ChAdOx1 MERS повышала титры антител, и вирусная репликация полностью отсутствовала в ткани дыхательных путей этих макак-резусов. Мы также обнаружили, что антитела, вызванные MERS ChAdOx1 у макак-резус, нейтрализовали шесть различных штаммов MERS-CoV. Трансгенные мыши hDPP4, вакцинированные MERS ChAdOx1, были полностью защищены от болезней и летальности для всех различных штаммов MERS-CoV. Данные подтверждают дальнейшее клиническое развитие ChAdOx1 MERS.
[Ссылка]

Richman · 2020-05-02 23:56:40

ЛИКБЕЗ

Вениамин Зайцев

Поговорим с нашим генетиком в Шведском Центре генетических исследований О. Петтерссон. Тема для беседы у нас сегодня будет "Человек и вирусы".
Знаете ли вы, что 8% человеческого генома состоит из вирусов, встроенных в наш ДНК? Это т.н. ретровирусы, т.е. вирусы заражавшие наших далеких предков и, в конце концов, встроившихся в нашу ДНК.

Зачем? Почему? Как? Когда? Все ли вирусы так умеют? Что тогда бывает?

Начнем с ЗАЧЕМ и ПОЧЕМУ?.
Лично я, персонально, наплевав на международную номенклатуру, считаю вирусы скорее живыми (тащите меня в суд). Они не организм, они простейшая эволюционная единица. Почему? У них есть геном - ДНК или РНК, хранитель их наследственной информации.
Как все знают, ДНК или РНК вирусов упакована в белковую оболочку, где у каждого белка своя функция.

Но не смотря на всю эту организацию, вирусы не умеют размножаться самостоятельно. И, как следствие, не могут эволюционировать сами по себе.
Для этого им необходим ничего не подозревающий хозяин, где вирусы внаглую заставляют клетки их размножать за свой счет. Чаще всего, это влечет за собой гибель клеток хозяина, т.е. болезнь.

Разные вирусы юзают хозяев по-разному.
Некоторые, как коронавирус (шоб он сдох, собака), просто, в наглую, призывает на службу наши рибосомы и заставляет их производить для себя белки. Также его гены используют все ресурсы клетки чтобы себя копипастить. Коронавирус только один из тысяч, которые идут этим путем.
Другие вирусы ведут себя иначе. Такие, как ВИЧ, герпес и ВПЧ (т.н. ретровирусы) не заморачиваются с нашими рибосомами. Они конкретно встраиваются в наши хромосомы, короче маскируются.
Наши белки, что отвечают за перевод ДНК в РНК для сборки белков (по-научному “генная экспрессия”) подвоха не замечают, и копируют инструкции для сборки вирусных белков наравне с нашими родными. Получается, вирус как-бы вклеивает свою страницу в нашу генетическую книгу.
Наши сварщики-рибосомы тоже ничего не замечают, и делают вирусные белки наравне с домашними. Секретные агенты вирусов в наших клетках потом эти вирусные белки собирают в скафандр, отзывают из нашего генома вирусную ДНК, пакуют все вместе, и сматываются.
Иногда убивая при этом клетку, а иногда просто смываются через дыру в заборе.

Вот вирусы второго типа очень часто остаются в геноме хозяина, даже после излечения. Геномы первого типа в ДНК хозяина вписываются крайне редко, и механизм этот изучен пока очень поверхностно.
КАК? ВСЕ ЛИ ВИРУСЫ ЭТО УМЕЮТ?

Чтоб РНК-вирусу вписаться в геном, у него должен быть два важных белка:
1) обратная транскриптаза и 2) интеграза.
Зверь под жутким именем “обратная транскриптаза” нужен чтобы переписать РНК вируса в ДНК (т.е. произвести транскрипцию). Без этого шага встраивание в геном хозяина невозможно.
Интеграза тащит на себе вирусную ДНК из цитоплазмы в ядро, где, собственно, и обитает наша ДНК. После того она, саботажница, в нашей ДНК делает надрез и вставляет в него ДНК вируса, а потом все аккуратненько склеивает чтоб никто ничего не заметил.
Та же интеграза заведует вылавливанием вирусной ДНК из генома, когда подходит пора рвать когти и идти заражать соседние клетки.

Для конспирологов говорящих о том что коронавирус встроится в наш геном и будет передаваться детям, таким образом их чипируя, так и отвечайте, что у коронавируса нет ни интегразы, ни обратной транскриптазы.
Даже если каким-то плохо исследованным макаром это произойдет, то никак не в ближайшую сотню тысяч лет.

Кроме РНК-, встроиться в геном хозяина могут и ДНК-вирусы, например вирус гепатита Б, аденовирусы, некоторые парвовирусы, итд. Механизм другой, но исход весьма похожий.
КОГДА?
Некоторые вирусы интегрируются в геном всегда, так проходит их жизненный цикл. Это вирусы ВИЧ и герпес, например. Даже у излечившихся людей, кусочек вируса навсегда остается в их ДНК. Они передаются от человека к человеку.
Чтобы они предались потомству, интеграция в геном должна произойти и у половых клеток, что маловероятно.

Другие вирусы обычно не остаются в геноме хозяина, но у них поломался механизм вызволения оттуда.
Со временем (сотни тысяч или миллионы лет), некоторые одомашненные вирусы смогли стать полноценными генами хозяев. А если они оказались репродуктивных клетках, то могут и передаваться по наследству.

Вот таких древних вирусов в нашем геноме процентов 8.
ЧТО ОНИ ДЕЛАЮТ?
Иногда весь вирус, или его прижившийся кусочек, встраивается в жизненно важный участок ДНК, или в особо восприимчивый тип клеток. Так коварен вирус папилломы человека (ВПЧ), который может (не всегда, но может!) вызвать рак шейки матки.
Есть типы лимфом и сарком, которые вызываются такими вирусами. Гепатит Б может вызвать рак печени (при особых условиях, у некоторых пациентов).

Есть древние вирусы, которые внедрились в наши гены и приносят эволюционную пользу.
Например, пара таких генов хорошо работают в человеческой плаценте, и участвуют во взаимодействии между матерью и плодом.
Абсолютное большинство таких старых вирусов одомашнились, мутации сделали их неактивными, и они просто сидят в геноме, ничего особо не делая. Со временем, если они не подвержены естественному отбору, они просто разрушаются.
Однако, все зависит от того, где в геноме они осели. Есть гипотеза, что такие вирусы играют роль в развитии множественного склероза, шизофрении, и некоторых других наследственных заболеваний.
Кроме ретровирусов типа ВИЧ, есть еще прекрасное подразделение вирусов которые тоже прекрасно встроились в наш геном и творят там всяческие чудеса - это т.н. транспозоны, или “прыгающие гены”. Их у нас в геноме аж за 50%. О них поговорим как-нибудь в другой раз.

Richman · 2020-05-04 00:36:31

Гонка в разработке вакцин, мир ещё не видел такую. Уже 6 вакцин закончили или закончат испытания 1-й фазы в этом квартале, а 3 компании заявили, что их вакцины могут получить разрешение на экстренное применение (EUA) от FDA уже этой осенью.

Richman · 2020-05-05 02:11:13

Керала (население 35 миллионов) была первым штатом в Индии, получившим COVID. Сегодня уже 2-й день подряд у них НОЛЬ новых случаев.
Удивительно, что они так быстро справились при такой плотности населения.

Coronavirus | For second day in a row, no new case in Kerala

Richman · 2020-05-05 11:29:21

Франция сообщила о первых случаях заболевания, связанного с SARS-COV-2, 24 января 2020 года. Оба случая имели историю поездок в Ухань. Насколько нам известно, эти 2 случая считаются первыми подтвержденными случаями во Франции.
Мы изучили медицинскую карту пациентов ОИТ, поступивших на ГПЗ в период с 2 декабря 2019 г. по 16 января 2020 г., с отрицательной ОТ-ПЦР, проведенной при поступлении. Каждый образец дыхательных путей, собранный в нашей больнице, замораживают при -80 ° C в морозильной камере ThermoScientific -86 ° C и хранят в течение четырех лет на случай необходимости дальнейшего анализа. Образцы, взятые у пациентов с симптомами "ИЛИ "(лихорадка выше 38,5 ° C, кашель, ринит, боль в горле или миалгия) и непрозрачность матового стекла в соответствии с их медицинской историей, были подвергнуты ОТ-ПЦР SARS-COV-2.
Один образец был положительным, взятым у 42-летнего мужчины.
27 декабря 2019 года он поступил в отделение неотложной помощи с кровохарканьем, кашлем, головной болью и лихорадкой, развивающимися в течение 4 дней. Первоначальное обследование было незаметным, и проведенная компьютерная томография выявила двустороннюю непрозрачность матового стекла в нижних долях ). при поступлении у него была лимфопения, повышенный уровень С-реактивного белка и фибриногена, в то время как про кальцитонин находился в пределах нормы. В образце мокроты, взятой в отделении неотложной помощи, патоген не был идентифицирован. Пациент был помещен в реанимацию с антибиотикотерапией, и его развитие было благоприятным до выписки 29 декабря 2009 г.

[Ссылка]

P.S. Более ранняя дата означает, что, вероятно, коронавирус распространялся по всему земному шару в течение нескольких недель или месяцев, прежде чем он был обнаружен китайскими учеными в группе сльких недлучаев аномальной пневмонии в Ухане.
Французский пациент не выезжал за границу с августа 2019 года, когда он посетил свой родной Алжир. У одного из его детей были симптомы гриппоподобного заболевания до того, как он заболел, что является потенциальным признаком того, что ребенок также заразился коронавирусом.
Обе эти подсказки указывают на то, что человек заразился вирусом от кого-то другого, и что распространение вируса в сообществе происходило задолго до того, как его обнаружили ученые.
Есть достаточно признаков того, что коронавирус распространяется гораздо шире, чем известно. Два недавних исследования показали, что около пятой части всех инфицированных людей не имеют никаких симптомов вообще. Более половины тех, кто дал положительный результат на вирус, не могут определить, как они были заражены, что является еще одним признаком бессимптомного распространения.

Соединенные Штаты обнаружили свои собственные случаи коронавируса, чем первоначально предполагалось. Офис медицинской экспертизы в Санта-Кларе, штат Калифорния, недавно реклассифицировал смерть женщины в начале февраля как вызванную коронавирусом, примерно за три недели до первой известной смерти в США

Richman · 2020-05-05 12:09:59

Керала, Индия, внедряет «тестирование, отслеживание, изоляцию, поддержку» и пока окупается. Они прилагают все усилия, чтобы сохранить количество случаев на низком уровне.
Что значит поддержка? Местные работники здравоохранения спрашивают тех, кто изолирован: Каково ваше состояние? У тебя заканчиваются запасы еды или нет и когда доставить? Они работают над тем, чтобы жители деревень, принимающие лекарства, получали свои таблетки вовремя.
Местный сельский совет побудил местных общепитовцев открыть кухню. Они предоставляют бесплатные обеды для более чем 1200 человек в этом районе. Они также построили временные приюты для размещения трудящихся мигрантов.
ВОЗ приписывает «быстрое реагирование» Кералы на его прошлый «опыт и инвестиции» в области готовности к чрезвычайным ситуациям и указывает на такие меры, как районный мониторинг, информирование о рисках и вовлечение сообщества.
Но самое главное, что Керала столкнулась со вспышкой смертельно опасного вируса Нипах в 2018 году. А это вам не Ковид-19, Нипах убивает 75% заразившихся, а выжившие инвалиды, лучше в 75% при Нипахе. Вот чего надо бояться, что мутирует и станет легко передаваться. Регион очень серьезно относится к угрозе инфекционных заболеваний. «Мы были готовы с самого начала. Мы поняли, что приближается шторм. Поэтому мы начали возводить нашу оборону »- говорит чиновник здравоохранения штата.

Richman · 2020-05-05 12:45:12

Нью Йорк говорит своим жителям: “WE GOT YOU COVERED”.
Со вчерашнего дня во всех пяти районах Нью Йорка начали бесплатно раздаваться 7.5 миллиона бесплатных масок и защитных покрытий лица.
Будет роздано 5 миллионов масок и 2,5 миллиона тканевых покрытий для лица в парках, на улицах, продуктовых магазинах, повсюду.
Мэр Нью Йорка де Бласио сказал: “Куда вы ни повернётесь, вам предложат покрытие для лица, и это будет продолжаться в течение нескольких недель, чтобы убедиться, что у каждого есть то, что ему нужно”.

Richman · 2020-05-05 12:46:27

Ян Полянский

Прислала нам Франция сегодня чек на оплату коммунальных услуг на 76 евро.
Не в смысле вы должны оплатить 76 евро, а в смысле вот вам 76 евро чтобы вы могли оплатить ваше потребление по комуналке.

Это при том, что нам продолжают платить зарплату, и мы сидим дома на карантине с 11 марта и уж точно не в нужде.

Richman · 2020-05-05 12:48:07

Александр Флинт

Вот мне пришло по почте. Грубо говоря - коммунизм уже наступил. Это предложение различных вариантов помощи и подарков, если у вас есть бизнес и вас задело вирусом и кризисом. Тут и отсрочка кредитов, и новые кредиты, и разные помощи бесплатно, и просто подарки. Например сразу дают 10.000$ в подарок бизнесу, которые можно не возвращать. Всё от Конгресса - спасибо всем, кто за это в Конгрессе проголосовал.

p.s. Отдельно, тут умеют делать рекламу - у мужика явно взгляд в будущее, с полным облегчением, на фоне электропилы и промышленной дрели )))

10 штук на руки, если твой бизнес накрылся медным тазом изза всего и всякого... возвращать не надо!

Richman · 2020-05-05 23:44:29

Вениамин Зайцев

Идея о том, что SARS-CoV-2 - это искусственный вирус, поражает воображение, но менее вероятна, чем другие истории происхождения.
Эксперты по вирусной генетике и появляющимся вирусам уже описали вероятный путь для SARS-CoV-2; одна из ступенчатой эволюции согласуется с паттернами, часто встречающимися среди других коронавирусов в недавней истории. Манипулирование коронавирусом летучей мыши или его синтетическим созданием потребует очень высокого уровня знаний в области коронавируса и молекулярной вирусологии , не только для его конструирования, но и для отслеживания следов этой конструкции.

Эксперты в данной области описали эволюционную модель генетических различий и мотивов, которые отличают SARS-CoV-2 от любого другого известного коронавируса.

Нечестивым агентам также потребуется доступ к специализированным реагентам и оборудованию. Это не невозможно, но маловероятно. Разведывательное сообщество США соглашается с научным консенсусом ; что SARS-CoV-2 вряд ли был генетически модифицирован или создан в лаборатории.

Лабораторное исследование дикого(природного) вируса пошло не так?

Нет никаких доказательств того, что ученые где-либо ранее работали с SARS-CoV-2, это просто утверждение ничем не обосновано . Но если SARS-CoV-2 действительно сбежал из лаборатории, история гласит, что, возможно, его перенес в общество через зараженное лабораторное животное или заразившегося исследователя. Процедуры биобезопасности должны были быть полностью несостоятельными, чтобы это произошло; это что-то неслыханное, такого быть не могло
Допустим он сбежал из лабы и оказался в дикой природе, проблема заключается в том, что как вирус распространился среди животных или людей и оттуда путешествовал по всему миру. Другая очевидная проблема с этой версией заключается в том, что вирус также мог произойти естественным путем, без этого запутанного лабораторного посреднического процесса.
Более 60% новых или возникающих инфекционных заболеваний у людей происходят от животных; они зоонозы . Люди имеют долгую и разнообразную историю приобретения зоонозов. Мы знаем, что вирусы гриппа А - «обычная» причина человеческих пандемий - являются птичьими вирусами, которые передаются многим другим млекопитающим, часто когда эти животные держатся близко друг к другу. Пандемический вирус человеческого гриппа 1918 года имеет общие черты с вирусами птичьего гриппа, в то время как пандемия 2009 года имела эволюционную связь от свиней. Предполагалось, что эпидемия лихорадки Эбола в Западной Африке в 2014–16 годах, которая привела к беспрецедентным уровням заражения и смерти, началась, когда человек был заражен летучей мышью .
SARS-CoV-2 - седьмой коронавирус, который, как известно, вызывает заболевание человека, и третий, связанный с летучими мышами, в течение 20 лет. Существует прецедент, подтверждающий естественное происхождение SARS-CoV-2 как зооноза. Ученые проследили происхождение различных эндемических коронавирусов человека (229E, OC43, NL63, HKU1) от летучих мышей через грызунов, коров или верблюдов, теперь, возможно, панголин, до людей. При эпидемии атипичной пневмонии 2002-04 гг. Причина SARS-CoV возникла из-за коронавируса летучей мыши, который, вероятно, прошел через пальмовых циветт или енотовидных собак . Для MERS-CoV путь был, вероятно, от летучей мыши до верблюда и к человеку. Оба вируса перешли на людей, которые приносили фермерских или экзотических животных, каждый со своими большими, но плохо изученными вирусными популяциями, в непосредственную близость к другим животным и к нам.
Трансмиссивные зоонозы, вызванные вирусом реки Росс и вирусом Зика, произошли после взаимодействия между резервуаром для животных, переносчиком комаров и нами. Мы делаем эти взаимодействия более вероятными, посягая на места обитания, воссоздавая подходящие места обитания рядом с нами, или через изменение климата.

У нас нет доказательств, но у нас есть прецедент
Ученые допускают возможность того, что новые доказательства могут раскрыть факты, подтверждающие другую историю происхождения. Нет никаких прямых доказательств в поддержку истории побега или модификации в лаборатории более или менее, чем история эволюционных классиков. Но у нас есть доказательства естественной эволюции: очень близкородственный коронавирус подковообразной
летучей мыши, который, вероятно, все еще разделен сотнями генетических различий, приравнивающихся к десятилетиям эволюционных различий; коронавирусы панголина, которые, как правило, более отчетливы, но имеют определенную генетическую последовательность; миллионы потенциальных рисков ежегодно летучим мышам коронавирусы; широкое, разнообразное и неизведанное созвездие коронавирусов летучих мышей; хорошо известная картина смешения и мутации среди коронавирусов и множество прецедентов. Косвенные данные свидетельствуют о том, что SARS-CoV-2 произошел от людей и животных, вновь вступивших в тесный контакт. Эксперты не удивлены, что SARS-CoV-2 стал еще одним зоонозом.
Мы также не должны упускать из виду политизацию этой темы, желание распределить вину и недостаток опыта среди источников, предпочитающих более захватывающий, но плохо поддерживаемый рассказ. В основе версии о естественной эволюции лежит знание о том, что привычки человека вновь создали условия и способствовали распространению нового инфекционного патогена.

Это будет не последний случай, когда мы столкнулись с недавно появившимся коронавирусом. Надеемся, что в будущем лучше финансируемая наука подготовит ответы для общественности и наших лидеров на решение сложных научных концепций, с которыми мы пытаемся смириться во время COVID-19.
(Ян Маккей PhD и Кетрин Е. Арден PhD )

P.S.Я спросил Др. Т.Бедфорда(занимается анализом секвенированных геномов коронавируса), а мог ли он (коронавирус)попасть в Ухань из другого региона Китая или страны, через зараженных людей например?

Он ответил, что степень генетического разнообразия (в действительности его отсутствие) в ранних случаях в Ухане предполагает, что распространение произошло именно в Ухане.

Richman · 2020-05-06 00:09:09

В большинстве развитых стран дневная кривая смертности стабилизировалась, кое-где уменьшение.

Richman · 2020-05-06 00:24:07

Максимальная смертность за неделю на пике эпидемии по сравнению с другими годами в городах сильно превышает средние значения.

В эквадорской провинции Гуаяс имеем всплеск +487%
В Мадриде +256%
В Бергамо, Италия +463%
В Нью-Йорке +387%

По графикам видно, что у многих вершина пика ещё впереди.

Richman · 2020-05-06 14:02:30

Американские ученые: Новая мутация сделала коронавирус еще заразнее
Однако, не спешите пугаться. Вениамин Зайцев поговорил об этом с известными учёными и написал большую намного более оптимистичную статью...

Richman · 2020-05-06 14:09:43

Вениамин Зайцев

В конце апреля вышла работа группы Б.Корбера о мутации шипа и наличии более передаваемой формы. Вчера вышли уточнения. Привожу:
"Мы разработали аналитический конвейер, чтобы упростить отслеживание мутаций в SARS-CoV-2 в реальном времени, первоначально сфокусировавшись на белке Spike (S), поскольку он опосредует заражение клеток человека и является целью большинства стратегий вакцинации и терапии на основе антител. На сегодняшний день мы выявили четырнадцать мутаций в Спайке, которые накапливаются. Мутации рассматриваются в более широком филогенетическом контексте, географически и с течением времени, чтобы обеспечить систему раннего предупреждения для выявления мутаций, которые могут давать избирательные преимущества при передаче или устойчивости к вмешательствам. Каждый из них оценивается на предмет положительного отбора, а последствия мутации исследуются с помощью структурного моделирования. Мутация Spike D614G вызывает крайнюю озабоченность; после начала распространения в Европе в начале февраля, когда его вводят в новые регионы, он многократно и быстро становится доминирующей формой. Также мы представляем доказательства рекомбинации между локально циркулирующими штаммами, что указывает на множественные штаммовые инфекции. Эти находки имеют важное значение для передачи SARS-CoV-2, патогенеза и иммунных вмешательств."

Вопрос интересный, но делать пока определенно какие-то выводы об увеличении трансмиссивности и влиянии ее на ход заболевания пока рано. С этим вопросом мы обратились с специалисту по генетике, который отслеживает мутации коронавируса Тревору Бедфорду:

-мутация в белке спайка D614G вызывает увеличение трансмиссивности вируса SARS-CoV-2. Я считаю эту гипотезу правдоподобной, но далеко не доказанной.
Я внимательно наблюдал за D614G, поскольку мутации в белке спайка заслуживают дополнительного внимания из-за роли спайка в связывании с человеческим рецептором ACE2.
Эта мутация D614G произошла в цепи передачи, которая первоначально привела к вспышке в Европе в январе 2020 года. Почти все вирусы, обладающие этой мутацией, происходят от этого первоначального внедрения в Европе.

Да в европейских вирусах преобладают D614G из-за эффекта основателя, при котором первоначальное введение включало эту мутацию. Если мы посмотрим на географическое распределение D против G у секвенированных вирусов, мы увидим Европу с G, Азию в основном D и смесь в США и Австралии.
(Что в России мы не знаем, т.к. мало представлено секвенированных геномов прим. мое)
-Основная находка Korber et al. Заключается в том, что D614G, по-видимому, увеличивается со временем в секвенированных геномах SARS-CoV-2. Я настоятельно предупреждаю против интерпретации избирательных эффектов в глобальной частоте D614G. - продолжает Др. Бедфорд
Его глобальная частота сильно спутана с эпидемиологическими обстоятельствами, то есть, возможно, G преобладает, потому что ему повезло в европейском введении. Однако региональные частоты должны быть более устойчивыми к этому смешиванию (хотя и не совсем так).

Эти рисунки повторяет результаты Korber et al, используя nextstrain (ресурс секвенированных геномов вируса со всего мира, прим. мое)
Здесь я показал штаты в США и Австралии с более чем 70 доступными последовательностями и нашей оценкой частоты D (зеленый) против G (желтый) с 1 марта по 15 апреля.
Все еще очень возможно, что эта мутация могла появиться из повторных передач из Европы / Нью-Йорка в США, распространяющих вариант G, и многочисленных форм из Европы, распространяющих G в Австралии.
Альтернативное объяснение, выдвинутое Корбером и др., Заключается в том, что этот паттерн обусловлен тем, что вариант G является более передаваемым. Я думаю, что это возможно, но трудно различить эти гипотезы только с этими частотными данными.
Дополнительные доказательства гипотезы о функциональном эффекте D614G получены из наблюдения Корбера и др., Что вариант G имеет более низкое пороговое значение цикла (Ct) в клинических образцах из Шеффилда. Это указывает на возможную более высокую вирусную нагрузку у этих людей.

Благодаря работе
Кассии Вагнер и П. Ройчадхари
а также
мы видим эту разницу в Ct между D и G реплицируется в
UWVirology
образцы.

Предварительный анализ здесь: [Ссылка]
Здесь также есть поводы для беспокойства (прежде всего, от момента появления симптомов до сбора образцов), но я полагаю, что репликация в двух исследуемых популяциях наводит на мысль о влиянии D против G на значение Ct и, возможно, вирусную нагрузку.
Как Korber et al, так и наш анализ не показывают измеримого влияния на исход пациента. Следовательно, гипотеза на данный момент полностью с точки зрения передаваемости, а не тяжести заболевания
Подытоживая сказанное важно отметить, что ни Бедфорд ни я не согласны с тем, что «нет никаких доказательств» того, что G является более передаваемым. Есть некоторые доказательства, но это далеко не убедительно.
Пока нам приходится мириться с этой неопределенностью в отношении функционального влияния D614G, в то время как собирается больше данных. Но нам нужно:
1. Исследования клеточных культур для демонстрации эффекта in vitro.
2. Дальнейшие клинические сравнения между пациентами с D против G
3. Более тщательный эпидемиологический анализ
Работа по конвейеру мутации шипа здесь: [Ссылка]

Когда вы встретите публикации об убийственной мутации шипа, то вы будете готовы и есть куда отослать паникеров) Всем спасибо. Так победим!

Richman · 2020-05-06 23:33:38

Вениамин Зайцев

Давайте повторим пройденный материал, а то я смотрю многое уже стали забывать. Итак:
Коронавирусы, которые представляют собой несегментированные РНК-вирусы позитивного смысла, принадлежат к семейству Coronaviridae . Они широко распространены у людей и других млекопитающих. Ранее было известно, что шесть видов коронавирусов вызывают заболевания человека, включая HCoV-229E, HCoV-OC43, HCoV-NL63, HCoV-HKU1, SARS-CoV и коронавирус респираторного синдрома на Ближнем Востоке (MERS-CoV). Первые четыре вида вызывали только легкие симптомы, но SARS-CoV и MERS-CoV вызвали более 10 тысяч кумулятивных инфекций у людей за последние два десятилетия с показателями смертности ∼10% для SARS-CoV и ∼34% для MERS- CoV, соответственно. SARS-CoV-2 является седьмым номером семейства коронавирусов, которые могут инфицировать людей. Хотя уровень смертности SARS-CoV-2 ниже, чем у MERS-CoV и SARS-CoV, его пропускная способность (медиана R 0 : 5,7) намного выше, чем у MERS-CoV (R 0 : <1) или SARS-CoV (R 0 : 3). Анализ секвенирования генома клинически изолированных образцов от пациентов показал, что SARS-CoV-2 имеет 88% сходство нуклеотидов с двумя SARS-подобными коронавирусами летучей мыши, bat-SL-CoVZC45 и bat-SL-CoVZXC21, но имеет только около 79% и 50% идентичности с SARS-CoV и MERS-CoV, соответственно. Геном SARS-CoV-2 и других появляющихся патогенных коронавирусов человека кодирует четыре основных структурных белка, включая шип (S), мембрану (M), оболочку (E) и нуклеокапсид (N), а также шестнадцать неструктурных белков (nsp1- 16) плюс пять-восемь вспомогательных белков. Среди них SARS-CoV-2 использует белок S для связывания ангиотензинпревращающего фермента 2 рецептора клетки-хозяина (ACE2) для проникновения в вирус ( Fig. 1 ) и последующего патогенеза. Филогенетический анализ показал, что летучие мыши могут быть основным резервуаром для SARS-CoV-2, в то время как промежуточный хозяин все еще находится под следствием, это панголина. Др. Дорстен(Германия) уверен, что если его откомандируют в Китай с группой ученых он найдет промежуточного у енотовидных собак, которых разводят на фермах.

Richman · 2020-05-07 00:09:53

Смотрим обзор всего, что мы знаем (и не знаем) об иммунологии COVID19.
Прекрасная работа!

[Ссылка]

Richman · 2020-05-08 12:35:09

Хорошая история о том, как спортивный аналитик создал аналитическую платформу для прогнозирования развития Ковид. Платформу стали использовать и в Белом доме. Это очень хороший пример сотрудничества людей из разных областей, для общего блага!

How a hockey analyst is helping experts in the fight against COVID-19

Richman · 2020-05-09 12:36:54

Вирусолог Питер Пиот, директор Лондонской школы гигиены и тропической медицины, заболел COVID-19 в середине марта. Он провел неделю в больнице и с тех пор восстанавливается в своем доме в Лондоне. Подняться по лестнице все еще вызывает одышку.

Пиот, родился и вырос в Бельгии, был одним из первооткрывателей вируса Эбола в 1976 году и всю свою карьеру боролся с инфекционными заболеваниями. Он возглавлял Объединенную программу Организации Объединенных Наций по ВИЧ / СПИДу в период с 1995 по 2008 год и в настоящее время является советником по коронавирусу при президенте Европейской комиссии Урсуле фон дер Лейен. По словам Пиота, его личная борьба с новым коронавирусом изменила его жизнь.

Вот просто несколько отрывков из его рассказа:

...Многие люди думают, что COVID-19 убивает 1% пациентов, а остальные у которых легкие симптомы все сойдет с рук. Но история становится все сложнее. Многие люди останутся с хроническими заболеваниями почек и сердца. Даже их нервная система нарушается. Во всем мире будут сотни тысяч людей, возможно, еще больше, которые будут нуждаться в лечении, таком как почечный диализ, до конца своей жизни. Чем больше мы узнаем о коронавирусе, тем больше возникает вопросов. Мы учимся во время плавания. Вот почему меня так раздражают многие сторонние комментаторы, которые без особой проницательности критикуют ученых и политиков, изо всех сил пытающихся поставить эпидемию под контроль. Это очень несправедливо.
...Сегодня, через 7 недель после выписки, я впервые чувствую себя более или менее в форме. Я ел белую спаржу, которую я заказал у турецкого торговца за углом моего дома; Я из Кербергена, Бельгия, это сообщество по выращиванию спаржи. Мои снимки легких, наконец, выглядят лучше. Я открыл хорошую бутылку вина, чтобы отпраздновать,это первое, что я отметил за долгое время. Я хочу вернуться к работе, хотя моя деятельность на некоторое время будет ограничена. Первое, что я снова начну делать, - это моя работа в качестве специального консультанта по исследованиям и разработкам против COVID-19 для фон дер Лейен.
...Комиссия твердо привержена поддержке разработки вакцины. Давайте проясним: без коронавирусной вакцины мы больше никогда не сможем нормально жить. Единственная реальная стратегия выхода из этого кризиса - это вакцина, которая может быть развернута по всему миру. Это означает производство миллиардов доз, что само по себе является огромной проблемой с точки зрения логистики производства. И, несмотря на все усилия, до сих пор нет уверенности в том, что разработка вакцины против COVID-19 возможна.

Сегодня существует также парадокс, что некоторые люди, которые обязаны своей жизнью вакцинам, больше не хотят, чтобы их дети были привиты. Это может стать проблемой, если мы хотим развернуть вакцину против коронавируса, потому что, если слишком много людей откажутся присоединиться, мы никогда не сможем контролировать пандемию.
‘Finally, a virus got me.’ Scientist who fought Ebola and HIV reflects on facing death from COVID-19

peterpiot_1280p.jpg?itok=P6Wrp4_R

Roza

Richman · 2020-05-09 12:42:55

Russia Is Boasting About Low Coronavirus Deaths. The Numbers Are Deceiving.
Increasing transparency by Russian officials shows that 233% more coronavirus-positive patients died in at least two regions than reported in the total count. But the country stands by its classification method.

Added after 69 s

Richman · 2020-05-09 15:33:25

В этом исследовании один коронавирус, выделенный из малайского панголина, показал 100%, 98,6%, 97,8% и 90,7% идентичность аминокислот с SARS-CoV-2 в генах E, M, N и S соответственно. В частности, рецептор-связывающий домен в S-белке Pangolin-CoV практически идентичен домену SARS-CoV-2, с одним некритическим различием аминокислот. Результаты сравнительного геномного анализа позволяют предположить, что SARS-CoV-2 мог возникнуть в результате рекомбинации панголин-CoV-подобного вируса с Bat-CoV-RaTG13-подобным вирусом. Панголин-CoV был обнаружен в 17 из 25 проанализированных малайских панголинов. Инфицированные панголины показали клинические признаки и гистологические изменения, и циркулирующие антитела против Pangolin-CoV реагировали с белком S SARS-CoV-2. Выделение коронавируса, который тесно связан с SARS-CoV-2 в панголинах, позволяет предположить, что они могут выступать в качестве промежуточного хозяина SARS-CoV-2. Недавно идентифицированный коронавирус у млекопитающего, которым больше всего торгуют, может представлять будущую угрозу общественному здоровью, если торговля дикими животными не будет эффективно контролироваться.

[Ссылка]

Трансерфинг реальности

Объявление

Внимание! Регистрация временно недоступна

#1 2011-08-10 14:48:18