Коронавирус / Coronavirus / COVID-19

Richman · 2011-08-10 14:48:18

Актуальные данные здесь.

AdSence · 2011-08-10 14:48:18

Richman · 2020-03-27 02:20:19

В США сейчас насчитывается 82 000 случаев коронавируса. Больше чем в Китае.

Нью-Йорк — новый пандемический очаг

AdSence · 2020-03-27 02:20:19

Richman · 2020-03-27 02:21:45

Исследователи из штата Небраска обнаружили РНК SARS-COV-2 в пробах воздуха, взятых из комнат пациентов с COVID19 (у всех было легкое заболевание). Невозможно доказать цитопатический эффект в культуре клеток.

[Ссылка]

Richman · 2020-03-27 04:45:33

Новые исследования показали, что может возникнуть вторая волна инфекций.

По мнению медицинских экспертов, до 14 процентов пациентов с излеченным коронавирусом в Китае вновь дали положительный результат.

Исследования показали, что от 3 до 14 процентов пациентов были диагностированы с коронавирусом после того, как им уже подтвердили выздоровление..

В одной из больниц в Ухане врачи обнаружили, что пять из 147 пациентов в исследовании снова показали положительный результат после выздоровления, сказал вчера Ванг Вай, директор городской больницы Тунцзи, государственному телеканалу CCTV.
На другом брифинге заместитель директора Центра по контролю и профилактике заболеваний, доктор Сонг Тай, сказал, что нет четкого заключения о том, почему это происходит и могут ли такие пациенты быть заразными.

В соответствии с исследованиями, проведенными в Ухане, у пациентов в Ухане не было никаких симптомов после повторного положительного теста.

Исследователи также не нашли никаких доказательств того, что они все еще были заразными, поскольку все члены семьи дали отрицательный тест.
Эксперты боятся потенциальной крупномасштабной второй вспышки в Китае.

Начиная с субботы, Китай закроет свои границы для большинства иностранцев, объявило правительство в четверг.

Richman · 2020-03-27 05:46:03

Richman · 2020-03-27 05:47:26

Richman · 2020-03-27 14:02:52

COVID-19 признан самой сильной респираторной инфекцией со времён "Испанки".

Richman · 2020-03-27 21:23:40

919 смертей за сутки в Италии, всего 9134 смерти из которых 44 медработники + 86 500 подтвержденных случаев заражения, из которых 6500 медработники + 3700 пациентов в ОАИТ в настоящее время
Просто цифры в моменте, для тех кто считает, что это просто грипп, а такие еще есть.

Richman · 2020-03-28 00:16:08

ИТАЛИЯ: 101-летний мужчина, который родился во время пандемии испанского гриппа, выздоровел от коронавирусной инфекции
shok

Richman · 2020-03-28 03:27:29

До появления вакцины от нового коронавируса пройдет не меньше года — директор программы ВОЗ по чрезвычайным ситуациям Майкл Райан

Ун-дина · 2020-03-28 12:32:46

vadim_zeland_official ОБРАЩЕНИЕ ТАФТИ К СВОИМ УЛИТКАМ
/ Предупреждение. Данный текст составлен по мотивам книг «Тафти жрица» и «Жрица Итфат», и с реальностью ничего общего не имеет. /
.
Уважаемые улитки! Обращаюсь ко ВСЕМ вам со своим обращением. Как вы знаете, ВСЕ – это мы все вместе. Но оказалось, что это не так. Среди нас завелись ОСТАЛЬНЫЕ.
Для того чтобы отделить остальных от всех, требуются МЕРЫ. А посему, я объявляю всеобщий СЕРПАНТИН. .
Серпантин означает, что улиткам теперь надлежит вместе не собираться, а по сторонам разбегаться. Чтобы не стать остальными, нужно быть как все. Но не всем вместе, а каждому по-отдельности. Надеюсь, это понятно. Остальных же, следует изолировать. .
Остальные – они не такие, как все. Они другие. Они чужие. Свойство <быть не такими как все> передается заразным путем. Поэтому, охота на остальных будет производиться в соответствии с мерами. .
Меры, в свою очередь, вводятся соответственные. Кто не хочет соблюдать серпантин, тех будут отлавливать и сразу сажать в тюрьму. Улиток, вернувшихся из-за границы, тоже будут сажать в тюрьму, потому что некогда с вами разбираться. Тот, кто посмеет куда-то выйти или отправиться, автоматически причисляется к остальным. .
Серпантин объявляется внутри каждой улиточной семьи. Это означает, в гостиную не выходить, по коридору не разгуливать, всем сидеть по своим углам и ракушкам. Срок серпантина, по желанию подавляющего большинства ВСЕХ, назначается бессрочным. .
Аналогично, по добровольной воле ВСЕХ, серпантин налагается на всех членов семьи, домашних животных, а также на кухню и туалетную комнату (включая туалетную бумагу). Холодильник, кухонная плита и туалет закрываются и прекращают работу на все время серпантина. .
Мужчинам запрещается размахивать руками, женщинам петь, детям скакать и кричать. Домашние животные должны быть обернуты в несколько слоев марли с ног до головы или с головы до ног. Лица ВСЕХ должны изображать маску скорби, дабы быть отличными от ОСТАЛЬНЫХ. .
В противном случае, будет объявлен всеобщий пластилин, а может быть даже крепдешин. .
Зато отныне разрешаю вам не работать, а зарплату получать. Откуда она возьмётся – не вопрос. Вы же знаете, нет ничего невозьмёжного.

Niagara, Мэри, Nataly London, Маска

Richman · 2020-03-28 23:08:42

Количество летальных исходов от коронавируса в США сегодня превысило отметку в 2000 человек и на данный момент составляет 2190.
Цифры приводит
@JohnsHopkins

Richman · 2020-03-29 10:35:01

Карантинные мероприятия служат для того, чтобы избежать взрывного роста заболевших, при котором количество людей, одновременно нуждающихся в медицинской помощи, превышает возможности системы здравоохранения оказать им всем помощь.

Когда такое происходит, в действие вводятся давным давно определённые протоколы реагирования на такую ситуацию. Эти протоколы прекрасно знают эпидемиологи, врачи, изучавшие медицину катастроф, а также все студенты медицинских ВУЗов, посещавшие занятия на кафедрах военной медицины.

Самые опытные врачи освобождаются от всех своих обязанностей и становятся на сортировку поступающих больных. Их задачей становится отсортировать пациентов по степени тяжести - на тяжёлых, средней тяжести и лёгких.

Все остальные врачи занимаются лечением ТОЛЬКО больных средней тяжести.

"Лёгким" даются инструкции по поводу того, как они могут помочь друг другу, чем они и занимаются под надзором санитарки или наименее опытной медсестры.

Тяжелобольные отправляются в палаты умирать. На них не будут тратить вообще никаких ресурсов. Если кто-то из них доживёт до того момента, пока окажут помощь всем больным средней тяжести, то тогда врачи и займутся ими. Это выглядит жестоко, но только так можно вылечить максимально возможное количество людей. Иначе, пока врачи будут возиться с одним "тяжёлым", умрёт несколько больных средней тяжести, а ещё с десяток "средних" перейдёт в разряд "тяжёлых".

Первоначальная сортировка - самая сложная и ответственная работа, и именно поэтому на неё выделяют самых опытных врачей. Врачи с недостаточным опытом могут не справиться с психологическим давлением и занять драгоценные ресурсы, например, безнадёжным ребёнком или безнадёжной беременной женщиной. Или же они могут потратить драгоценные ресурсы на "лёгких", у которых больше всего сил, и которые из-за этого гораздо громче и активнее требуют оказания помощи именно им.

В случае с коронавирусом, в разряд "тяжёлых" будут определены люди пожилого возраста, а также больные достаточно серьёзными хроническими заболеваниями всех возрастов. Не соблюдая карантин, именно вы приговорите большинство из них к смерти. Потому что вы или те, кого вы заразили в инкубационный период, займут те ресурсы системы здравоохранения, то время врачей и медсестёр, и те аппараты искусственной вентиляции лёгких, которые могли быть потрачены на их спасение.

Richman · 2020-03-29 14:16:24

MIT работает над проектом дешёвого open-source аппарата ИВЛ.
Сайт проекта
Документация прототипа от 2010 года

MIT_E_Vent_Mannequin_ControllerBoard_3_16_20I4193W-1-1536x1075.jpg

Richman · 2020-03-30 01:43:18

Теперь ресурс где анализируются все геномы вируса доступен на русском! Это большая и важная работа! Спасибо!

Мы провели анализ 1,495 общедоступных геномов COVID-19. Сопоставив эти геномы вируса между собой, мы можем охарактеризовать, как COVID-19 перемещается по всему миру и распространяется локально. В обновлениях этой недели мы сообщаем:

Европа

Мы продолжаем наблюдать сильное смешивание образцов по всей Европе, что свидетельствует о том, что вирус продолжал распространяться через границы в течение последних 3-5 недель. Поскольку мерам по смягчению последствий требуется некоторое время, мы можем увидеть дальнейшую кластеризацию случаев заражения по странам.
Северная Америка

В США схемы передачи вируса являются сложными: образцы, взятые с противоположных концов страны, по-прежнему, демонстрируют тесную взаимосвязь.
В штате Вашингтон было по крайней мере два независимых внедрения вируса (первое, вероятно, из Китая; второе, вероятно, из Европы), которые привели к двум отдельным цепям передачи.
Существуют доказательства вероятной локальной передачи вируса в нескольких штатах, особенно в Калифорнии.
Центральная и Южная Америка

На этой неделе мы получили новые последовательности из Южной Америки, но выборка остается разбросанной. В этом регионе может быть больше активности COVID, чем зафиксировано в доступных данных, но мы не можем сказать точно.
Азия

Мы находим доказательства недавнего экспорта COVID-19 из Ирана.
Африка

Филогения свидетельствует о вероятной местной передаче в городе Киншаса, Демократической Республике Конго, в течение последних 11+ дней.
На этой неделе мы получили новые последовательности из Африки, но выборка остается ограниченной; в этом регионе может быть намного больше активности COVID, чем зафиксировано в доступных данных.
Океания

Генетические данные свидетельствуют о локальной передаче в штате Новый Южный Уэльс в Австралии.

[Ссылка]

Ун-дина · 2020-03-30 15:07:32

положительная новость из серпантина -

для рожденных в СССР и дальше...от 62 года и выше в роддомах делалась обязательная прививка от туберкулёза (в странах соцблока тоже) она частично снижает риск заражения и смертности от ковида. Это наблюдают сейчас в Германии где легко сравнить территории бывших гдр и фрг. Италия и Испания отказались от этой обязаловки уже давно..

И эта вакцина серьезно рассматривается сейчас как одно из противоядий (вместе с антималярийными хининами) и медперсонал во многих странах вакцинируют прямо сейчас, чтобы встряхнуть их иммунную систему...

Richman · 2020-04-01 02:12:35

Китайские ученые выяснили, что 25% передачи происходит в бессимптомной форме при близких контактах. Теперь вот и до СДС дошло, что лучше маски носить всем.
"25% имеют НУЛЕВЫЕ СИМПТОМЫ!
25 процентов людей заражены COVID19 могут не проявлять симптомов - поразительно большое число, которое усложняет усилия по прогнозированию пандемии. Высокий уровень случаев отсутствия симптомов побуждает CDC рассматривать маски для общественности."

Richman · 2020-04-02 00:02:41

Навигация по пандемии Covid-19: мы просто карабкаемся на спасательный плот. Суша пока далеко

МАРК LIPSITCH и ЙОНАТАН ГРАД
Перевод Вениамина Зайцева
Статья Марка Липситча и Й.Гранда. Марку можно доверять, я часто его цитирую. Ведущий спец по эпидемиям.

Вы находитесь в маленькой лодке, далеко от берега. Неожиданный шторм опрокидывает лодку и бросает вас в море. Вы пытаетесь укротить свою панику, как-то найти надуманный, но все еще плавающий спасательный плот, и боретесь с ним. Вы отдышались, оглядываетесь и пытаетесь думать, что делать дальше. Ясно мыслить трудно после почти тонущего опыта.

Тем не менее, вы понимаете две важные вещи: во-первых, плот спасает вашу жизнь на данный момент, и вам нужно оставаться в нем, пока у вас не будет лучшего плана. Во-вторых, плот не является жизнеспособным долгосрочным вариантом, и вам нужно добраться до земли.

В апреле 2020 года шторм - это пандемия Covid-19 , спасательный плот - это сочетание интенсивных мер, которые мы используем для замедления распространения вируса, а засушливые земли - это конец пандемии.
США все еще находятся в фазе «подъема в спасательный плот», чтобы отреагировать на Covid-19, и до сих пор трудно понять, что делать дальше. Эта путаница затруднила оценку двух фактов: один из них заключается в том, что социальное дистанцирование в сочетании с расширением масштабов тестирования, производством медицинского оборудования и другими контрмерами имеет важное значение и должно распространяться по всей стране, усиливаться и продолжаться. Другое состоит в том, что если эти меры имеют желаемый эффект сокращения числа новых случаев, накапливающихся каждый день, они обеспечивают лишь временное решение.
Несколько стран в Азии контролировали свои эпидемии до заражения большинства населения. Некоторые, такие как Тайвань и Сингапур , сделали это, сдерживая инфекции с самого начала. Другие, такие как Китай и Корея, сделали это только после крупных вспышек. Контролем, которого они достигли, является только спасательный плот, а не суша, потому что, если не было необычайно высокого уровня инфекции, который был настолько слабым, чтобы остаться незамеченным, большинство людей в этих странах по-прежнему подвержены инфекции.

Вирусы не помнят, что ранее находились под контролем, и возродятся, когда ограничения будут сняты. Достаточно взглянуть на то, что произошло в 1918 году , когда города, которые подавили передачу гриппа, сняли свои ограничения, и передача гриппа вновь возросла. Математические модели Covid-19 нашей группы и других , включающие эти уроки, показывают, что в краткосрочной перспективе социальное дистанцирование и другие вмешательства могут снизить воздействие вируса. Но те же модели показывают, что когда эти вмешательства ослабляются, проблема возвращается.
Давайте внесем ясность. Covid-19 - это первая вершина и целая эпидемия. Что касается первого пика, данные пока указывают на тревожную возможность подавления наших отделений интенсивной терапии - даже с той степенью социального дистанцирования, которого мы достигли - как мы видим в Нью-Йорке . Но каждый раз, когда мы замедляем и сглаживаем кривую, это будет менее вероятно и менее драматично, если и когда это произойдет.
Вполне возможно, что после того, как эта первая волна спадет, у нас все еще будет в значительной степени восприимчивое население, хотя это зависит от того, насколько хорошо работает социальное дистанцирование. Эффективное лечение и увеличенная пропускная способность отделения интенсивной терапии могут снизить потребность в интенсивной терапии, облегчая нагрузку на систему здравоохранения, но, опять же, эти меры только замедляют процесс.

Если вирус SARS-CoV-2 имеет заразность три, то есть каждый случай заражает трех других людей, то мы не дойдем до конца эпидемии, пока две трети населения не приобретут иммунитет от инфекции или вакцинации. Успешный контроль над первым пиком инфекции может сделать большинство (возможно, значительное большинство) населения США все еще чувствительным к вирусу.

Существует несколько широких идей о том, как добраться до засушливых земель, что является распространенным иммунитетом среди населения. Но у каждого есть огромные проблемы.
Один из способов - в скором времени прекратить социальное дистанцирование и позволить эпидемии развиваться. Это привело бы ко многим смертельным случаям и полностью разрушило бы системы здравоохранения по всей стране. Другой способ - поддерживать интенсивное социальное дистанцирование до тех пор, пока не появится вакцина, но появление вакцины неясно и, если не будет чуда, вероятно, займет больше года. Тем временем общество и экономика пострадают.

Если первая волна действительно подконтрольна, другой вариант будет заключаться в том, чтобы попытаться провести несколько раундов социального дистанцирования: заставить ее взять под контроль эпидемию, а затем отказаться, возможно, только в определенных областях, чтобы позволить случаям происходить и постепенно накапливаться иммунитету у населения, а затем снова вводить еще один раунд социального дистанцирования. Наша модель этого процесса показывает, что он займет несколько раундов и будет сложно выполнить без ошибок, которые приводят к перегрузке ICU. Также было бы трудно поддерживать политическую и социальную волю для реализации этого.

Наиболее амбициозным подходом будет усиление социального дистанцирования и расширение тестирования до тех пор, пока мы не сможем узнать почти о каждом случае Covid-19, отследить его или ее контакты и контролировать распространение заболевания по одному случаю за раз. Это, однако, трудно представить. Несмотря на то, что Сингапур обнаружил инфекцию на ранней стадии, Covid-19 расширил систему общественного здравоохранения острова до предела, и наша система общественного здравоохранения не имела практики и ресурсов, выделенных для остановки пандемии, которую Сингапур инвестировал с тех пор, как он столкнулся с серьезной острой проблемой. респираторный синдром (SARS) в 2003 году. И сохраняющийся риск завоза Covid-19 из других стран мира - или даже из других частей страны - привел бы нас в этом лучшем случае к ограничению и интенсивному досмотру путешественников в течение длительного периода ,

Поскольку эпидемии и ответные меры на них носят локальный характер, сценарий в одной части США может отличаться от сценария в другой. Отчет Института моделирования заболеваний предполагает, что даже относительно быстрый ответ Сиэтла, возможно, только замедлил распространение инфекции, и он может увидеть эпидемию с одним пиком, при которой большая часть населения была заражена, несмотря на усилия по социальному дистанцированию. Если точные, недавно опубликованные данные о лихорадке от компании, занимающейся сетевыми измерениями, показывают, что уровень заболеваемости может снижаться, а не просто расти медленнее, мы можем увидеть второй пик, когда усилия по социальному дистанцированию будут сняты.
(STAT)

Richman · 2020-04-02 13:48:06

Пункт диагностики в Южной Корее

Jassmine

Richman · 2020-04-03 13:06:24

Google запустила отслеживающий передвижения людей при пандемии сервис
На сайте будут публиковаться отчеты о том, какие места люди по всему миру посещали чаще, а какие — реже. Пока отслеживать перемещения будут на территориях 131 страны. Отмечать, в частности, будут посещения магазинов и рабочих мест

На сайте COVID-19 Community Mobility Reports будут публиковаться отчеты, в которых указано, где находятся пользователи сервисов Google. При этом компания обещает придерживаться собственной политики конфиденциальности и не будет раскрывать персональные данные, в том числе геопозицию или контактную информацию.

Для отчетов Google будет использовать анонимные данные, которые покажут посещаемость наиболее популярных мест, включая магазины, общественные заведения, аптеки, парки, рабочие места и жилые помещения. Компания будет следить за перемещениями людей по всему миру и сначала планирует представить информацию по 131 стране.

Подробнее на РБК:
[Ссылка]

[Ссылка]

Richman · 2020-04-05 14:16:46

Обращение врачей.
Болеют все. Многие могут умереть.
Медики перегружены.
Пожалуйста, не разносите заразу.

[Ссылка]

Richman · 2020-04-06 16:33:06

Александр Меликов

Друзья!
У меня подтвердился COVID-19.
Вот уже больше 10 дней я веду интенсивную борьбу с этой премерзопакостной хворью.
И как врач, и как пациент, позволю высказать своё мнение и предостеречь вас от этой дряни.
Скажу сразу - инфекция действительно гадкая..
Появляется внезапно и меняет все на то, что было ДО, и то, что будет ПОСЛЕ.
COVID-19 гораздо ближе, чем вам кажется. Он подошёл уже вплотную к каждому из вас, он скребется зубцами своей короны в вашу входную дверь..
Карантинные меры, которые принимаются сейчас - это не свалившиеся на голову выходные, это не праздник, а повод заняться профилактикой и, возможно, не подхватить эту инфекцию.
Врачи всех специальностей работают в авральном режиме.
Московским правительством и Департаментом здравоохранения проводится колоссальная работа по перепрофилированию стационаров, к чему уже подключены даже федеральные медицинские учреждения.
Стационары уже переполнены, врачи работают на износ.. И падают.. Как упал я.. Падают сильнее меня, как множество моих коллег, находящихся сейчас в больницах с двухсторонними пневмониями на кислородной поддержке.
Прошу вас, проявите благоразумие и не выходите лишний раз из дома!
COVID-19 обладает высоченной контагиозностью.
Пусть, так называемым аэрозольным путем, при чихании и кашле, он улетает недалеко, не более, чем на 1 метр, ибо сам по себе обладает тяжёлым весом. Но он осаживается на поверхностях и ждёт. Ждёт вашего прикосновения. Ждёт, когда потом вы почешете носик или глазик.
И он обязательно дождётся.
Посмотрите на катастрофическую ситуацию в Европе - развитые и цивилизованные страны: Италия, Испания, Франция, Англия...
Посмотрите на количество погибших.
И поймите наконец, что нас ждёт практически тоже самое..
И самое интересное: в свете последних событий, развеян миф, что коронавирус тяжело поражает лишь пожилых людей с кучей хронических заболеваний. Это не так! Сейчас основная масса пациентов в тяжёлом состоянии - это возрастная группа от 30 до 50 лет.
Но мы.. Но ВЫ можете ещё это остановить!
COVID-19 обладает ужасным свойством - практически молниеносно вызывать тяжелейшие двухстороннии пневмонии с вовлечением всех сегментов лёгких, острый респираторный дистресс синдром.
Лечение таких патологий очень тяжёлое и длительное. Да и в случае успешного разрешения этих пневмоний, слишком велик шанс дальнейшей инвалидизации..
Я ни в коем случае не пугаю вас, друзья мои!
Ещё полтора месяца назад я лично не относился к этой пандемии серьёзно.. Скажу честно, относился даже с некоторой иронией..
Но последние несколько недель заставили кардинально изменить свое мнение.
Что я могу посоветовать как врач и как пациент?
Повторю уже крылатую фразу - не выходите без надобности из дома.
Регулярно мойте руки с мылом, пользуйтесь антисептиками на спиртовой основе.
Надевайте маски в магазинах, транспорте и в любых общественных помещениях.
Не трогайте руками лицо. Вот вообще не трогайте. Да, тяжело. Но вы не трогайте.
Обрабатывайте свои гаджеты дезинфецирующими растворами по несколько раз в день.
Как бы ни было смешно - но пользуйтесь резиновыми перчатками.. В тех же магазинах и общественных местах.
А при появлении первых симптомов заболевания, как правило, высокой температуры, сухого кашля - незамедлительно обращайтесь к врачу!
Берегите себя и близких, будьте благоразумны.
Ну а я пошёл пить очередную порцию уже опротивевших таблеток.
Бой продолжается...

#covid19 #covid

Richman · 2020-04-06 23:01:09

оптимальная температура для коронавируса — 4 градуса тепла. При температуре воздуха в 70 градусов он погибает. При температуре в 22 градуса коронавирус способен существовать неделю, при 56 градусах — всего полчаса.

Richman · 2020-04-07 03:36:00

«Пациент с тобой разговаривает, а легких у него уже нет». Врач из Филатовской — о больных коронавирусом и сменах без перерыва
В красную зону коллег провожают, как на войну

Richman · 2020-04-07 21:26:53

"Когда гидроксихлорохин назначается отдельно, сердечный риск очень низок. Однако антибиотик (азитромицин), который назначают систематически в сочетании с Гидроксихлорохин в протоколе против Covid поддерживает эти аномалии.Кардиологический риск тогда усиливается, тем более, если есть другие связанные препараты, которые имеют такой же нежелательный эффект, если оксигенация крови не проводится хорошо или если содержание калия в крови низкое. Кроме того, эти препараты, если они назначены, должны быть под контролем ЭКГ при минимуме D0 и D2 » - сказал профессор Эмиль Феррари зав отделением кардиологии в больнице Пастера в Ницце

Richman · 2020-04-08 12:48:25

Вениамин Зайцев

ЛИКБЕЗ

Сегодня у нас тред от коллеги из шведской лаборатории по секвенированию геномов О.Петтерссон, т.к. она просто простудилась, а не подхватила коронавирус, она согласилась рассказать про тесты ПЦР.

Очень много вопросов. Какие тесты? Почему не хватает? Какая чувствительность? Сколько занимают по времени?
Для начала отмечу, что тест на вирус это не тест на беременность. Он занимает время и требует специального оборудования. Все по порядку.

Образцы для тестов обычно берут ватным тампоном (swab), довольно глубоко из носовой или ротовой полости. Иногда берут мазок со слизистой щеки или образец слюны. В больнице могут взять и другие образцы, типа мокроты, кала, итд. Иногда берут кровь.
Теперь, что и зачем.
Мазок берут для диагностики, это самый распространенный вид сбора образцов, его на коронавирус берут всегда.
Мокроту или образцы из нижних дыхательных путей - иногда, для подтверждения диагноза у пациента в интенсивке.
Кал чаще всего берется для исследований, узнать сколько вирусных частиц выходят из организма этим путем.
Из всех этих образцов выделяют вирусную РНК.

Кровь - для переболевших, подтвердить что человек перенес болезнь. В плазме живого вируса нет, зато есть приобретенные к нему антитела. Такие тесты сейчас делают в Китае, в Европе такие тесты сейчас либо находятся в разработке, либо уже начинают выпускаться.
Вчера США зарегистрировали один такой тест.
Теперь КАК.
Итак, есть у нас ватный тампон. Его кладут либо в пластиковый кармашек, либо в пробирку, все маркируется и отвозится в лабораторию. Лаборант отрезает тампон от палочки и кладет его в буферный раствор. Что есть на тампоне?
Суп, в основном состоящий из наших клеток, наших родных микробов, и, само собой, вируса. Раствор отделяет все клетки и частички от ватки, и растворяет оболочки клеток и вирусные скафандры. Это надо делать в спец. лаборатории, т.к. до добавления раствора вирус заразен.
После того, раствор переносят в другую пробирку и добавляют белки, которые переводят РНК в ДНК (15-30 минут).

Тут начинаются различия между методами.

На полученный суп из разных ДНК можно сделать простой тест ПЦР
В роли затравки в ПЦР - два кусочка ДНК, тождественные 1 или 2 белковым протеинам.

Да, вирус постоянно мутирует, но некоторые участки его генома очень консервативны. Вот их и используют для затравок (праймеров).
Если в результате ПЦР на геле видна полоска, то диагноз подтвержден.

Простой тест ПЦР быстр (15-30 мин на подготовку и раскапывание, 45-60 мин сам тест + 30-45 мин на форез) и дешев, а ПЦР аппараты широко распространены.
Но чувствительность такого теста несколько сотен копий вируса на пробирку.

Намного более точна квантитативная ПЦР (или ПЦР реального времени, qPCR). Для определения вируса добавляют множество разных затравок и флуорофор. Тут не делают гель и ищут полоски. Спец. камера и компьютер в машине определяет все копии вирусных генов, т.к. они флуоресцируют.(фото1)

Чувствительность qPCR в разы выше чем простой ПЦР (несколько копий на пробирку, около 98-99%). Но она дороже, и аппараты могут быть не в каждой больнице. Особенность - тест не просто позитивен или негативен, он еще и квантитативен, т.е. можно определить вирусную нагрузку.
ПЦР и qPCR аппараты бывают на 8-24-48-98-384 пробирки.
Имеем: 15-30 мин на выделение РНК, 30-45 мин на перевод РНК в ДНК, 30-45 минут смешать реагенты и раскапать их по пробиркам, 1 час сделать ПЦР. Это МИНИМУМ 3 часа.
За раз, сделать 24 или 48 пробирок можно, но устанет рука (наделала сотни, если не тысячи таких в аспирантуре, на своей шкуре знаю). Профессиональное заболевание лаборантов-молекулярщиков - тендонит,
он же воспаление связок большого пальца правой руки, или хроническая боль в грудном отделе позвоночника. Руки ж постоянно навесу.

Большой объем тестов делают не в пробирках, а в специальных кюветах (microtiter plates), на 96 или 384 образца.(фото2)

Есть хитрые пипетки которыми можно готовить 8 образцов параллельно. Есть лабораторные роботы, которые могут сильно облегчить работу лаборанта. Их используют с ПЦР аппаратами на 96-384 образцов. Все это стоит немало.(фто3)

Практически во всем мире для диагностики Covid-19 наиболее широко применяется именно метод qPCR, причем с множественными затравками, т.к. она минимум в 10 раз более чувствительна чем любой другой тест.
Множественные затравки нужны чтобы поймать максимальное количество генов вируса, не смотря на возможные мутации.

Есть и более быстрые тесты на основе ПЦР, где вирус определяется уже на стадии перевода его с РНК в ДНК. Но там выше погрешность.
Можно делать ПЦР даже не выделяя РНК, просто на растворе с ватки. Но опять, высока погрешность.

Ученые из Китая и наши, стокгольмские, разработали тест LAMP. Это подвид ПЦР, но намного проще.
Вкратце, если тест положительный, то меняется цвет реакции. У нас такие тесты, надеюсь, скоро поставят на поток.
Есть и другие методы. Один из них - ИМБ, или иммуноблот. Из образца выделяют все белки, их денатурируют, разгоняют в электрофорезе, переносят из геля на мембрану, ее обрабатывают пробами (антителами) на нужный белок вируса, красят, а потом фотографируют.
Есть пятно - есть реакция = есть вирус.
Чувствительность ИМБ максимум 60%.

Сам ИМБ я никогда не делала, но делала его двоюродного брата, т.н. блот Саузерна. Возни минимум на три дня. Не знаю, может его улучшили и ускорили, врать не буду.
Есть и экспресс тесты, одна или две полоски. Но ни один из них официально не зарегистрирован, т.к. их чувствительность до конца не исследована. В данный момент используется только в Китае. Предполагаемая чувствительность 89%.
Эти тесты занимают 15 минут, для них достаточно капли крови. Однако, это не тест на вирус! Это тест на наличие инфекции в теле, причем любой, т.к. определяется уровень иммуноглобулина в крови.

С видами тестов разобрались. Золотой стандарт в мире - qPCR.
Почему их не хватает?
В тест входят:
- особая ватка на палочке (не абы какая, не на любой палочке)
- раствор для выделения РНК
- набор реагентов для синтеза ДНК из РНК
- затравки и реагенты для ПЦР или qPCR
- собственно qPCR аппарат

Все компоненты закупаются у разных компаний, и практически никогда не продаются полным набором.

Сейчас весь мир кинулся закупать ватки, растворы и прочие реагенты. В первые недели пандемии, простейшие наборы реагентов стали жутким дефицитом...
но сейчас, похоже, их производство наладили.

К тому плюсуем наличие обученного персонала и ПЦР аппаратов большой мощности.
Т.е. образцов-то оно много, но их еще надо успеть обработать, и не неделю, а БЫСТРО, желательно в течение дня.
В чем еще могут быть проблемы с тестами. Основные >
А) Ложные отрицательные, даже у чувствительных ПЦР. Тут проблема в том, что иногда не получается полностью растворить бактериальные клетки после переноса их из мазка.

Остатки клеточных оболочек могут снизить эффективность перевода РНК в ДНК, а так же чувствительность ПЦР. Тут крайне важна методика и хорошие реагенты.
Ложные положительные. Это когда фрагменты откопипащенной ДНК начинают витать в воздухе в виде аэрозоля. Они для нас безвредны, но могут осесть на пробирках, буферных растворах, пипетках, итд.
Чтобы этого избежать, всегда используется негативный контроль (чистая вода). Если в пробирке с водой находят вирусные гены, то тесту верить нельзя и нужно выкидывать все открытые реагенты и санировать аппаратуру.
Какие тесты делают в России у меня спрашивать бесполезно, я просто не знаю.

Зная общее положение дел, могу предположить что qPCR аппараты есть далеко не везде.
Вот, вкратце, все что нужно знать о тестах на коронавирус на данный момент.
Спасибо Ольге за хороший тред по тестам! Здоровья и не заболеть!

Добавлю по нашим тестам.

Существуют разные стратегии борьбы с эпидемией. Одна из них, успешно применяется в Ю.Кореи, в Сингапуре и Исландии, предполагает раннюю диагностику COVID-19, изоляцию больных и лечение.
Очевидно, что при существующем качестве диагностики у нас осуществление этой стратегии вряд ли способно дать результат. Вероятно, поэтому принято решение о финансировании разработки и совершенствовании имеющихся отечественных тест-систем.
В условиях проведения диагностики тестами с низкой чувствительностью нет смысла искажать статистику. Невысокая результативность тестирования – не показатель низкой распространенности COVID-19 в России, а признак недостаточного качества диагностики.

P.S. Вот нашел его! Уже в работе, только недавно про него писал, а он уже тестирует!
Работает методом изотермической амплификации (амплификация РНК с постоянной температурой), такие используются на новых машинах Abbott (фото4), могут усиливать и обнаруживать РНК SARS-CoV-2 за 5-13 минут.

Трансерфинг реальности

Объявление

Внимание! Регистрация временно недоступна

#1 2011-08-10 14:48:18